2次元ゲル電気泳動技術と質量分析技術は、現在、プロテオミクスの研究に最も広く使用されている方法です。二次元ゲル電気泳動技術は、タンパク質等電点と分子量差を利用して、様々なタンパク質を区別します。低存在量のタンパク質を2次元ゲル電気泳動で区別することは困難ですが、操作の要件は高いですが、高スループット、分解能、再現性が高く、質量分析と組み合わせる特性が最も一般的で信頼性の高いプロテオミクス研究方法です。2次元ゲル電気泳動技術および質量分析ベースのプロテオミクス研究手順は→、サンプル調製法→アイソ電焦点化→ポリアクリルアミドゲル電気泳動→ゲル染色→→目的のタンパク質スポットを掘り出す→ペプチドまたはペプチドの偏形アミノ酸配列を決定する→酵素を決定する。プロテオミクスの研究では、高分解能タンパク質分離と正確で感度の高い質量分析法の同定技術が必要です。ゲル電気泳動におけるタンパク質の着色は、タンパク質分離の分解能に影響するだけでなく、その後の質量分析法の同定にも影響を与えます。タンパク質染色は、有機試薬染色、銀染色、蛍光染色、同位体着色の4つのカテゴリーに分けられます。
Unlu et al. 蛍光差動ディスプレイ2次元電気泳動(F-2D-DIGE)定量プロテオミクス分析法を提案した。差動ゲル電気泳動(DIGE)は、2-DEの技術改善です。複数の蛍光分析の方法を組み合わせたものである。同じゲル上で異なる蛍光で標識された複数のサンプルを分離し、内部の基礎となる概念を導入します。2つのサンプル中のタンパク質は、2-DEを実行して2-DEを実行し、2つのサンプル中のタンパク質の発現を検出するために異なる蛍光標識と混合され、結果の精度、信頼性および再現性が大幅に向上します。DIGE技術では、各タンパク質スポットには独自の内部標準があり、ソフトウェアは各タンパク質スポットの内部標準に従って自動的にその発現を較正し、検出されたタンパク質の豊富な変化が真実であることを確認することができます。DIGE技術は、様々なサンプルに適用されています。